miRNA-149表达变化对肝细胞癌患者预后的影响及潜在机制探索
Electronic Journal of Liver Tumor(2020)
摘要
目的:探讨miRNA-149表达水平变化对肝细胞癌患者预后的影响及潜在机制.方法:从TCGA数据库选取344例肝细胞癌患者临床及基因组数据,按照miRNA-149表达水平的高低分为高表达组(n=172)和低表达组(n=172).绘制两组患者生存曲线,并分别比较肿瘤分期不同的患者体内miRNA-149的相对表达水平差异.各选取与miRNA-149正、负相关系数最高的前50个基因进行生物学注释、分类和编码蛋白之间的相互作用分析.另取32例肝细胞癌患者肿瘤样本,RT-PCR法检测miRNA-149、谷氨酸脱氢酶1(GLUD1)和羟基类固醇17-β脱氢酶4(HSD17B4)的表达水平,比较不同分期患者miRNA-149表达差异.将32例患者分为miRNA-149高表达组(H组)和低表达组(L组),比较两组患者临床数据差异.结果:miRNA-149低表达组患者的中位生存时间长于miRNA-149高表达组,差异有统计学意义(2532d比1271d,P<0.001).根据病理分期进行分组,Ⅰ期患者miRNA-149表达水平显著低于Ⅱ、Ⅲ期的患者(P<0.05).根据T分期进行分组,其中T1期患者miRNA-149表达水平显著低于T2、T3期患者(P<0.05).miRNA-149相关基因主要涉及的生物学过程为生物调节;主要涉及的分子功能为蛋白质结合;主要涉及的细胞组分为细胞膜,主要涉及的信号通路为细胞外基质代谢通路.GLUD1和HSD17B4是处于相关基因编码蛋白之间的相互作用网络核心的蛋白.与H组比较,L组GLUD1和HSD17B4基因表达均较高(P<0.05).临床样本中不同分期患者miRNA-149表达水平差异有统计学意义(P=0.019),其中Ⅲ期患者miRNA-149表达水平显著高于Ⅰ期或Ⅱ期患者(P<0.05).结论:miRNA-149高表达与肝细胞癌患者远期预后不良有关,这可能与其靶向调控谷氨酸及雌二醇代谢通路有关.
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