利用GEO在线数据构建脑胶质母细胞瘤ceRNA网络

目的 构建胶质母细胞瘤(GBM)ceRNA调控网络,探讨其发病机制.方法 利用GSE103229数据集的芯片数据,分析GBM中异常表达的lncRNA、mRNA和miRNA,差异基因判定标准为logFC>1,P<0.05.通过数据库分析三者之间的靶向调控关系,构建ceRNA网络并用Cytoscape软件可视化.结果 GBM差异基因中,lncRNA 1326个,癌组织中上调743个,下调583个;差异mRNA 3743个,癌组织中上调1865个,下调1878个;差异miRNA 33个,上调9个,下调24个.构建了包含miR-124、miR-128、miR-138和miR-193b的GBM的ceRNA网络.结论 成功构建了GBM相关的ceRNA网络,其中miR-124、miR-128、miR-138和miR-193b是重要的节点基因.