申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析

Journal of Diagnosis and Therapy on Dermato-venereology(2020)

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Abstract
目的:初步预测及分析申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,Ss.)对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因(4Hppd)编码蛋白的结构和生物学功能特征.方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss.4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征.结果:Ss.4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52.0 kD,等电点为5.98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中.其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度.结论:预测Ss.4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考.
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sporothrix schenckii,4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase,bioinformatics analysis
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