2010-2012年北京市部分地区MSM中HIV-1急性期感染者的毒株亚型和流行状况

Chinese Journal of AIDS & STD(2017)

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摘要
目的 研究北京市男男性行为者(MSM)艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的毒株亚型、流行现状和变化规律.方法 采用单纯随机抽样的方法,抽取北京佑安医院2010-2012年新发现的MSM HIV-1急性期感染者的血样共100人份,采样前均未进行抗病毒治疗.提取外周血单核细胞(PBMC)中的脱氧核糖核酸(DNA),用巢式聚合酶链式反应(PCR)扩增病毒env、gag和pol基因区序列,三区中如有扩增失败,则尝试提取血浆中的核糖核酸(RNA),反转录后进行巢式PCR扩增.PCR产物测序后进行基因亚型分析.计算pol基因区样本间基因离散率,并做系统进化树分析.结果 有96份样本的基因序列扩增成功,检出的基因亚型有CRF01_AE、CRF07 BC、B、B'、CRF55_01B、CRF65_cpx和未知亚型,所占比例依次为42.7%、25.0%、15.6%、1.0%、1.0%、3.1%和11.5%.前3种亚型合计占83.3%.各亚型所占比例与相关文献相比有明显变化,表现为CRF07 BC亚型所占比例的快速上升和B亚型所占比例的显著下降.发现了新亚型CRF65_cpx、CRF55_01B和一些未知亚型.结论 2010-2012年,北京市MSM HIV-1急性期感染者的HIV-1毒株亚型分布与相关报道相比已经发生改变,建议对北京地区HIV-1毒株的流行和变异进行密切监测.
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关键词
HIV-1,Men who have sex with men,Subtype,Phylogenetic tree
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