上海市男男性行为者中感染HIV-1的CRF01_AE毒株传播簇分析

目的 了解上海地区男男性行为者(MSM)中,感染艾滋病病毒1型(HIV-1)的CRF01_AE重组型的流行情况、成簇特性,为HIV防控工作提供科学数据.方法 从2009-2013年每年新诊断的MSM HIV-1感染者血浆样本中提取RNA,并对HIV-1 pol基因片段进行反转录和巢式PCR扩增、DNA测序和亚型分析.对CRF01_AE重组型序列进行系统进化学和社会人口学信息分析.结果 1262名MSM感染者中,CRF01_AE重组型感染782人(62.0％),其序列在系统进化树上形成6个流行簇.使用不同参数界定传播簇并进行比较,选择以Boot-strap≥90％及基因距离≤0.03作为传播簇的界定标准,形成112个传播簇,其中由10条及以上序列形成的传播簇有5个;年龄、文化程度、婚姻状况、性病史和CD4+T淋巴细胞计数与样本的成簇性有统计学关联.结论 CRF01_AE重组型毒株是上海市MSM HIV-1感染者中的优势传播株,具有较强的成簇性,并且与相关的社会人口学和流行病学背景相关.