基于Oncomine数据库的数据挖掘在头颈鳞状细胞癌研究中的应用实例

Juan Fang, Jingjing Song,Da Ma, Yanqiong Wang,Fangjing Zhou,Zhi Wang

International Journal of Stomatology(2014)

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摘要
目的:利用Oncomine数据库结合自身样本验证,获取靶分子钙调蛋白在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达信息。方法???利用Oncomine数据库挖掘钙调蛋白在HNSCC中转录水平的变化,采用反转录聚合酶链反应、免疫印迹技术在本地区小样本队列中验证其转录及蛋白表达水平。结果钙调蛋白在Oncomine数据库大多数HNSCC队列中呈现转录水平的高表达,少部分呈现低表达;本地区样本结果显示,钙调蛋白在转录及蛋白表达水平均呈现高表达。结论??Oncomine数据库大样本量数据的挖掘并结合本地区样本的验证,能迅速准确地获取钙调蛋白在HNSCC中表达的相关信息,为后续的深入研究奠定基础。
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关键词
Oncomine database,calmodulin,head and neck squamous cell carcinoma
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