足体调节蛋白SH3PXD2B基因生物信息学分析

目的 利用多种生物信息学方法,研究SH3PXD2B基因序列信息和蛋白结构,为今后进一步验证该基因在口腔颌面头颈部的功能提供依据.方法 从Genbank得到SH3PXD2B序列,采用基因结构分析,预测该蛋白的亚细胞定位、二级结构、三级结构、功能结构域和抗原表位等信息.结果 SH3PXD2B基因编码长度为911aa的蛋白,具有1个PX和4个SH3结构域,蛋白理论分子量为101579.0,理论等电点为8.82.蛋白结构中α螺旋占21.62%,β转角占6.70%,无规则卷曲占58.95%.蛋白结构中无信号肽,但有4个跨膜结构,和8处抗原表面位点.蛋白互作网络显示,与其互作蛋白多与细胞伪足形成和细胞粘附有关.进化分析显示家猪、家兔等与人SH3PXD2B基因相似性更高.结论 利用生物信息学方法预测SH3PXD2B蛋白的结构和功能,能为其在口腔颌面头颈部功能的研究提供信息基础.