新生小鼠与成年小鼠心肌mRNA差异表达谱分析
Clinical Journal of Medical Officers(2020)
摘要
目的 探讨新生心肌细胞与成体心肌细胞间mRNA的表达差异与心肌细胞增殖的关系.方法 选取新生24 h和8周龄雄性C57BL/6J小鼠各3只为研究对象.收集所有小鼠心肌组织标本,进行RNA提取及转录组芯片(Agilent-085631)分析.获取两组小鼠差异表达的mRNA,进一步通过生物信息学分析明确差异表达显著的信号转导通路及相关调控基因.结果 通过样本变异性检测确认两种小鼠心肌组织标本有效性.进一步通过芯片分别获得14644个差异表达的mRNA,其中成体小鼠心肌组织中上调表达6428个基因,下调表达8216个基因.进一步应用GO和KEGG富集分析软件证实,有54个与细胞周期相关的基因在两种小鼠心肌细胞中存在差异表达.结论 细胞周期相关调控基因作为主要调控因子,参与了成年小鼠心肌细胞增殖抑制的调控.
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