IL-17A在卵巢癌中的表达水平及潜在机制的生物信息学分析

Military Medical Journal of Southeast China(2020)

引用 2|浏览5
暂无评分
摘要
目的 探讨白细胞介素-17A(IL-17A)在卵巢癌组织中表达水平的变化及潜在机制. 方法 选取武警特色医学中心2018年1月至11月间收治的原发性卵巢浆液性囊腺癌患者20例,采用ELISA法检测肿瘤组织及癌旁正常组织IL-17A表达水平.下载肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中549例卵巢浆液性囊腺癌数据,按照IL-17A表达水平由高到低排序,将排在前50%的患者设为高表达组,剩余患者设为低表达组,绘制2组患者生存曲线;利用在线分析工具(http://www.linkedomics.org)将数据库中每一种基因的表达水平逐一与IL-17A表达水平进行Pearson相关性检测,根据相关系数选取100个相关基因,使用DAVID工具完成基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书通路(KEGG通路)富集分析. 结果 癌组织IL-17A表达水平显著高于癌旁正常组织[(7.23±2.11)ng/L vs (4.19±1.33)ng/L,P<0.05];IL-17A高表达组中位生存时间高于IL-17A低表达组(1451 d vs 1348 d,风险比=0.74,95%CI为0.60~0.92,P<0.05);在检测的5309个基因中,有2103个基因与IL-17A存在相关性(P<0.05),其中钙电压门控通道亚单位α1 (CACNA1S)与IL-17A表达水平相关系数最高(r=0.6928,P<0.05);GO富集分析和KEGG通路富集分析可见,相关基因主要涉及的生物学过程包括生物调节、刺激反应和多细胞生物过程,主要涉及的细胞组分为细胞膜、细胞核和囊泡,主要涉及的分子功能为蛋白质结合、离子结合和转运活性,主要涉及的信号通路为泛醌10和其他萜类醌的生物合成、ATP绑定蛋白转运和类固醇生物合成. 结论 IL-17A可作为评价卵巢浆液性囊腺癌预后的指标之一,这可能与其调控细胞膜表面电压门控通道及萜类醌的生物合成有关.
更多
AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要