基底样乳腺癌预后标志物的基因表达谱分析

目的 分析基底样乳腺癌(BLBC)术后组织样本的基因表达谱数据,筛选与预后相关的基因.方法 从国际基因表达谱数据库GEO和EGA中检索并获取乳腺癌基因表达谱数据,按照PAM50分型得到BLBC样本,保留记录有生存信息且BLBC样本数量>20个的数据集,最终保留了4个数据集,共447个BLBC样本.采用Lipták′s weighted meta-z检验分析基因与生存时间的关系,并对预后相关基因进行功能注释.结果 通过分析,所得238个基因与BLBC预后好有关,62个基因与BLBC预后差有关(|meta Z score|<3.09,P<0.01).基因功能注释发现,预后好相关基因显著富集在免疫应答功能,而预后差相关基因没有显著富集的基因功能.结论 分析得到的238个基因和62个基因分别与BLBC的预后好和预后差有关,可能成为BLBC新的预后标志物.