甘蓝AP2/ERF转录因子的克隆和生物信息学分析

目的：：运用电子克隆的方法获得甘蓝中AP2/ERF转录因子基因。方法：以拟南芥的AP2/ERF转录因子作为探针，对甘蓝的EST数据库进行搜索，应用相关软件进行序列拼接组装和延长。结果：克隆出甘蓝两个AP2/ERF-B3亚族转录因子BoAP2/ERF1和BoAP2/ERF2。通过生物信息学方法，对两条序列编码蛋白质的氨基酸组成，亲水性/疏水性、理化性质、亚细胞定位、高级结构和空间构型等方面进行了预测和分析。结论： BoAP2/ERF1和BoAP2/ERF2基因由371和352个氨基酸组成、相对分子质量为40.85kDa和39.44kDa的蛋白质，定位于细胞核。序列分析结果显示，该蛋白可能具有信号转导和胁迫响应应答等功能。