miR-125b-5p在耐阿霉素乳腺癌细胞中的分子功能分析

目的 利用生物信息学方法寻找miR-125b-5p在人野生乳腺癌细胞(MCF-7)耐受阿霉素过程中所调控的相关基因,为后续的深入研究提供理论依据.方法应用RNAhybrid2.1.2、Miranda3.3a、TargetScan7.03种在线工具预测miR-125b-5p靶基因,取其交集靶基因;对交集靶基因进行Gene Ontology(GO)分子功能、生物学过程分析;根据MCF-7和人耐阿霉素乳腺癌细胞株(MCF-7/ADR)的RNA-seq测序结果,筛选出与miR-125b-5p有关的显著差异表达基因.结果应用3种在线工具预测获得47个交集靶基因;miR-125b-5p靶基因GO分子功能集中于离子转运体活性、氧化还原酶活性以及MAP激酶活性;生物学过程集中于细胞周期调节、氧化还原调控、凋亡细胞清除(P<0.01);miR-125b-5p可能与CAMSAP3、PIGG、MAPK3、ANAPC15、STC2、NEIL1、BIN3和IGFALS 8个基因构成负调控关系;部分上皮-间叶转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关基因在MCF-7/ADR中明显发生变化.结论miR-125b-5p可能通过调控STC2和MAPK3的表达来参与乳腺癌耐阿霉素过程.