基于数据库分析脂肪非典型钙黏蛋白1在肝细胞癌中的表达及其临床意义

目的 基于Oncomine数据库和基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库数据挖掘,探讨脂肪非典型钙黏蛋白1(FAT1)在肝细胞癌(HCC)中的表达水平.方法 从Oncomine数据库筛选关于不同类型肿瘤中FAT1表达的研究数据,对关于HCC多组研究数据集进行荟萃分析,分析FAT1在不同数据集中的表达情况;从GEPIA数据库下载关于HCC组织FAT1表达的研究数据,以及HCC预后和基因分析信息,分析HCC组织与正常肝组织中FAT1的差异表达,Log-rank检验分析FAT1 mRNA与HCC患者生存期的相关性;应用STRING数据库分析FAT1相互作用的蛋白网络.结果 Oncomine数据库共收录463项关于FAT1在不同类型肿瘤的研究,有统计学意义35项,其中FAT1表达水平明显增高28项,FAT1表达水平明显降低7项.涉及HCC共5项研究,其中包括5个数据集、769个样本,5项研究中FAT1均呈高表达.FAT1在HCC组织中的表达水平显著高于正常组织(P<0.05).从GEPIA数据库筛选419例样本,其中HCC组织369例,正常肝组织50例,在HCC组织中FAT1表达水平显著高于正常组织(P<0.05).HCC患者FAT1表达水平与总生存率和无病生存率无相关性(P>0.05).与FAT1相互作用的蛋白有过氧化物酶体增殖物激活受体A重组蛋白、V-REL网状内皮增生病毒癌基因同源物A重组蛋白、特异性蛋白1、JUN、核因子-κB抑制剂α、原癌基因蛋白、肿瘤坏死因子、类视黄醇X受体A、一氧化氮合酶、COUP转录因子1等.结论 FAT1在HCC组织中呈高表达,但其表达水平与HCC患者的预后无相关性.