海藻糖低温保存血小板miRNA差异表达分析

Journal of third military medical university(2016)

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摘要
目的 探讨海藻糖低温保存血小板过程中miRNA的变化.方法 收集3份来自相同血型无偿献血员的单采血小板,少量混匀后,平均分为2组.对照组:新鲜血小板组(22℃,100%血浆储存的新鲜血小板2h);实验组:海藻糖低温保存血小板组(10℃,70%海藻糖保存液储存5d);采用高通量测序方法对两组样品进行了Small RNA测序,进行生物信息分析,主要包括已知miRNA鉴定、miRNA差异表达分析及富集分析.结果 2组样品经Small RNA高通量测序,平均每个样品获得了11兆净读值(Clean reads),经过生物信息分析,分别获得了821个已知miRNA.通过差异表达分析,在已知的miRNA中共有460个差异表达miRNA,其中194个miRNA表达上调,266个miRNA表达下调,其中显著差异表达已知miRNA共44个,分别在钙离子通路、MAPK通路、凋亡路径、轴突导向等储存损伤相关路径中富集程度较高.相对于对照组,实验组中hsa-miR-4449、hsa-miR-1296表达显著上调(P <0.01,且差异倍数>2),hsa-miR-665表达被抑制.结论 血小板经过海藻糖低温保存后的miRNA呈现出特征性表达变化,提示miRNA活动参与了低温时海藻糖对血小板储存损伤的保护作用.
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关键词
platelets,platelet storage impairment,microRNA,high throughput sequencing
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