新一代测序在脂肪肉瘤中的研究

目的 脂肪肉瘤(Liposarcoma,LPS)是软组织肉瘤(Soft tissue sarcoma,STS)最常见类型,具有显著的异质性.新一代测序(Next generation sequencing,NGS)技术提供了描述肿瘤分子病理特征的手段,有可能鉴定出潜在的治疗靶点.本研究使用NGS技术,展示了27例LPS的分子图谱,试图挖掘出新的治疗靶标.方法 选择2013年9月-2016年11月安徽省皖北地区27例LPS患者的石蜡包埋组织标本.利用Illumina HiSeq 4000的测序平台,对LPS进行全景癌症基因检测.通过生物信息学分析,鉴定出可能与LPS发生、发展相关的基因,并挖掘出潜在的治疗靶点.结果 27例样本中共检测到40个突变基因.频发的突变基因包括TP53(22.2％)、KMT2B (14.8％)、EP300 (11.1％)、NOTCH1 (11.1％)、PKD1(11.1％)、SMARCA4(11.1％).此外,我们也检测到了在其他肿瘤中存在的与用药或者预后相关的突变基因,如PTEN、ALK、BRAF、BRCA2、FGFR4等.在基因拷贝数变化方面,我们检测到了在LPS中已知的扩增基因MDM2(63％)和CDK4(59.3％),同时也检测到了新的扩增基因,如MCL1 (22.2％)、KITLG(7.4％)、SDHC(7.4％)、SGK1(7.4％)以及WISP3(7.4％).结论 本研究在LPS中检测到的基因变异,部分与已报道结果一致,如CDK4、MDM2、TP53等,同时也存在一些差异.检测到的扩增基因MCL1和KITLG等与肿瘤发生、发展密切相关,有可能成为潜在治疗靶点,值得进一步研究.