亚洲地区丙型肝炎病毒基因重组研究

目的 检测亚洲地区丙型肝炎病毒(HCV)基因重组事件,探讨其重组规律及重组病毒株的分布情况.方法 收集GenBank中HCV病毒基因全序列1 192条,标记病毒分离地点并选出亚洲地区HCV序列296条,利用MEGA4.1软件对齐整理,参照参考序列去除空位.利用最大似然法构建进化树,划分HCV基因型,统计出亚洲地区HCV不同基因型的分布特征.运用RDP4.0软件检测HCV中的重组事件,统计基因型内与基因型间重组事件的发生规律.结果 1型为亚洲地区流行的主要基因型,共检测到重组序列22条.结论 不同基因型HCV在亚洲各地区分布有差异.基因重组断点在HCV基因组中散在分布,可能影响HCV病毒学特性与临床特征.