低出生体重大鼠肾组织中lncRNA表达谱的差异分析

目的 应用长链非编码RNA(lncRNA)基因芯片技术分析低出生体重(LBW)大鼠肾组织中lncRNA的表达情况.方法 通过妊娠和哺乳期给予22％常规饲料建立Control组和6％低蛋白饲料建立LBW组大鼠模型.酸消化法计数生后10 d大鼠的肾小球数目;lncRNA芯片技术对两组大鼠肾脏表达的lncRNA进行差异筛选,生物信息学技术对差异显著的lncRNA与肾脏发育密切相关的编码基因mRNA行相关性分析.实时定量PCR(qRT-PCR)验证芯片结果并检测其在生后1 d和10 d大鼠肾组织中的表达水平.结果 LBW组大鼠生后1和10 d的体重、生后10 d的肾小球数目均低于Control组(均P<0.01),且肾小球数目与出生体重呈正相关(r s=0.73,P=0.003).基因芯片和信息学分析显示两组差异表达的lncRNA 42个(折叠倍率≥2,P<0.05),其中16种lncRNA与丝裂原活化蛋白激酶4(MAPK4)mRNA表达显著相关(r=0.90,P<0.05).qRT-PCR结果显示lncRNA TCONS_00014139和TCONS_00014138在生后1 d LBW组大鼠肾组织中相对高表达,生后10 d相对低表达,与肾单位数目呈正相关(P<0.01);lncRNA TCONS_00017119在生后1和10 d LBW组肾组织持续高表达,与肾单位数目呈负相关(P=0.001).结论 两组大鼠肾组织中存在lncRNA的差异表达,且与肾脏发育密切相关的MAPK4 mRNA的表达有关,其中lncRNA TCONS_00014139、TCONS_00014138和TCONS_00017119与肾单位数目显著相关,提示lncRNA在低出生体重大鼠肾脏发育障碍中可能发挥重要作用.