3-O-C12-HSL阻碍Mo-DCs成熟过程中lncRNA表达谱的变化

目的:观察铜绿假单胞菌(Pseudomonas aerltginosa,PA)分泌的信号分子N-3-氧代十二烷酰-L-同型丝氨酸内酯(N-3-oxododecanoy1-L-homoserine lactone,3-O-C12-HSL)阻碍单核细胞来源的树突细胞(monocytes derived-dendritic cells,Mo-DCs)成熟过程中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的变化情况.方法:采用免疫磁珠法分选人外周血CD14+单核细胞,经重组人粒-单核细胞集落刺激因子和重组人白细胞介素-4诱导分化为Mo-DCs.不同因素处理Mo-DCs,实验组加入终浓度0.1 μg/mL的LPS和口终浓度为40 μmol/L的3-O-C12-HSL,对照组加入相应体积的含0.1％DMSO的PBS,模型组加入终浓度0.1 μg/mL的LPS.利用lncRNA芯片技术检测对照组、模型组和实验组间lncRNA表达谱的差异.对筛选数据进行分析处理,利用散点图分析2倍以上差异lncRNA在各处理因素间的总体变异情况,利用聚类分析研究表达差异5倍以上lncRNA的聚类情况.结果:与对照组和模型组相比较,实验组筛选出2倍以上表达差异的lncRNA为1 386条,其中上调表达的548条,下调表达的838条.筛选出具有5倍以上表达差异的lncRNA共153条,占2倍表达差异lncRNA的11.04％,其中上调表达的22条,下调表达的131条.散点图发现2倍表达差异的lncRNA总体分布呈集中趋势,存在特征性改变.聚类分析发现5倍表达差异的lncRNA能根据处理因素进行有效的分层聚类.结合GO分析和mRNA通路分析,差异lncRNA的相关基因可富集至PPAR信号通路、钙信号通路和NF-κB信号通路中.结论:3-O-C12-HSL作用于Mo-DCs后,lncRNA表达谱发生了特征性变化,表达差异的lncRNA可能参与了3-O-C12-HSL阻碍Mo-DCs成熟过程.