基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子
Journal of Harbin Medical University（2017）
摘要
目的 挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力.方法 整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因.以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络.随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估.结果 各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子.结论 基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物.
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