应用R语言MetaOmics分析流程实现基因芯片数据的Meta分析

xiaoping LIU,Xiaodong LI,Jiao GUO,Yue CAO,Xiaohong YIN,Xincan LIU

Journal of Henan University(Medical Science)（2017）

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摘要

随着基因芯片技术的发展和检测成本的下降,近年来成千上万的基因表达谱研究被公开发表,因此基于基因表达芯片数据的Meta分析对于进一步验证具有重要意义.美国匹兹堡大学研究人员开发的基于R语言的MetaOmics分析流程目前包含的MetaQC、MetaDE和MetaPath程序包,可分别用于基因芯片数据Meta分析质量控制、差异基因筛选以及后续功能分析.本文以9例前列腺癌基因表达谱研究为例,介绍通过MetaOmics基因芯片数据实现Meta分析的具体步骤,为其临床应用提供参考.

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