长链非编码RNA linc00460在胃癌中的表达及对预后的影响
Journal of Nanjing Medicial University(2019)
Abstract
目的:探讨长链非编码RNA linc00460在胃癌中的表达及其与胃癌患者临床病理特征和预后的关系.方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)胃癌数据集系统评估linc00460的差异表达,并采用实时定量PCR(qRT-PCR)在88例接受胃癌手术的患者中验证TCGA结果.采用qRT-PCR检测胃癌细胞株和正常人胃上皮细胞中linc00460的表达情况.采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)法预测linc00460的调控基因.将AGS细胞分别转染linc00460过表达质粒(pcDNA-linc00460)和阴性对照序列(pcDNA3.1),分别采用Western blot检测相关蛋白表达和CCK-8法检测两组细胞的增殖情况.结果:我们发现并证实linc00460在胃癌组织和细胞中显著高表达(P<0.05);高linc00460表达与患者M分期相关;linc00460表达与胃癌患者总生存期之间存在显著负相关(P<0.05);且Cox比例风险模型的单变量和多变量分析证实其为胃癌相关独立生存预测因子(P<0.05).linc00460相对高表达样本富集到P53类介质对DNA损伤反应信号转导的调控(P=0.002)、P53类介质对信号转导的正向调节作用(P< 0.001)、细胞分裂的正向调节(P< 0.001)、核分裂的正向调节(P=0.002)等基因集.AGS细胞过表达质粒pcDNA-linc00460转染组中linc00460表达水平显著高于pcDNA3.1组,差异有统计学意义(P<0.05).Westernblot检测结果表明linc00460可下调P53蛋白表达,上调Bcl-2和Cyclin BI表达.CCK-8结果表明pcDNA-linc00460组AGS细胞增殖指数均高于pcDNA3.1组,差异有统计学意义(P<0.05).结论:linc00460在胃癌组织中高表达,且其高表达的患者预后较差,linc00460可能通过上调P53信号通路促进胃癌细胞生长,linc00460可能参与了胃癌的恶性进展.
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