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miR-363靶基因预测及生物信息学分析

Journal of Nanjing Medicial University(2015)

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Abstract
目的:初步明确hsa-miR-363潜在的生物学功能.方法:首先通过miRbase、UCSC等在线数据库对hsa-miR-363的碱基序列、基因位点及序列保守性进行分析;其次选择miranda、miRDB、PicTar及TargetScan四个在线数据库预测hsa-miR-363的靶基因并取交集,筛选后的靶基因用于后续分析;最后通过基因GO功能注释、富集分析和KEGG信号转导通路富集分析,初步阐明hsa-miR-363靶基因参与调控的细胞功能与信号通路.结果:根据生物信息学分析的结果显示,hsa-miR-363的功能较广泛,其多个潜在靶基因均参与子宫内膜异位症发生、发展过程中的多个生物学进程.结论:hsa-miR-363很可能与子宫内膜异位症的发病机制密切相关,并有可能为临床的靶向治疗提供潜在的新靶点.
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