大鼠坐骨神经Wallerian溃变过程中LncRNA的差异表达分析

目的:采用分子生物学和生物信息学方法筛选大鼠坐骨神经损伤后Wallerian溃变(Wallerian degeneration,WD)过程中的关键长链非编码RNA(long none coding RNA,LncRNA),并分析该关键LncRNA分子在大鼠坐骨神经损伤过程中的作用.方法:采用Affymetrix大鼠Non Coding RNA芯片,分析大鼠坐骨神经损伤后WD过程中差异表达的LncRNA;通过实时定量聚合酶链式反应验证关键LncRNA的表达;预测关键LncRNA相关基因及功能.结果:基因芯片分析结果显示共有显著差异性LncRNA 708个和mRNA 2649个,上调LncRNA 283个,下调LncRNA 425个.通过编码—非编码基因共表达分析和预测竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA,ceRNA)机制,显示在WD过程中发挥作用的LncRNA,其中上调19个,下调17个.WD早期差异表达的LncRNA靶基因11个,WD后期差异表达的LncRNA靶基因31个.结论:大鼠坐骨神经损伤后,LncRNA显著差异性表达,提示LncRNA在周围神经损伤修复与再生过程中可能发挥了一定作用,为进一步分析LncRNA在神经再生中的作用提供了实验基础.