长链非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的表达谱分析

目的 长链非编码RNA (lncRNA)在肿瘤的发生和发展中起重要作用.本研究使用基因芯片技术筛选甲状腺乳头状癌中差异表达的lncRNA,并对这些lncRNA调控的靶基因进行预测和分析.方法 本研究使用微阵列来研究3例甲状腺乳头状癌(PTC)和配对的邻近非癌性甲状腺组织中lncRNA的表达.基因功能通过GO(Gene Ontology,GO)和通路分析进行评估,并预测lncRNA潜在的靶基因.结果 与邻近的非癌性甲状腺组织相比,共有855个差异表达lncRNA,上调195个,下调660个(FC＞2,P＜0.05);2 370个差异表达mRNA,上调801个,下调1 569个(FC ＞2,P＜0.05).其中差异较大的lncRNA有23个,mRNA有79个(FC＞4).lncRNA-SLC34A2和它相关的mRNA GRCh38 (NM_001177998)差异表达最为显著(FC =23.5).差异表达的mRNA中显著富集的GO途径显示:一些与肿瘤有关,如“焦粘连”“ECM-受体相互作用”“MAPK信号传导途径”和“PI3K/AKT信号传导途径”.经过通路分析,42条信号通路在差异表达的转录后显著富集,其中“焦粘连”最为显著(P =8.499×10-7)并与47个差异表达基因有关.239个与其相关mRNA的lncRNAs可能与顺式调控有关.lncRNAs和mRNAs的位点之间的相对位置关系在基因的不同位点.结论 本研究是甲状腺肿瘤相关的LNCRNA谱的补充,发现了一定数量的差异表达的LNCRNA,并预测其功能靶向基因和途径.今后,笔者将选择更多的样本,深化对lncRNA分子机制和生化功能的研究,为甲状腺癌的早期诊断和治疗提供新的准确方法.