RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因预测

目的 探讨RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因.方法 利用慢病毒介导的RNA干扰技术,建立多批次RYBP基因稳定沉默的HL60细胞株及空载体对照组(NC);通过二代测序技术对不同批次干扰的上述3对细胞进行mRNA测序及miRNA测序,利用KEGG等生物信息学分析方法,预测靶基因.结果 成功构建RYBP稳定沉默的HL60细胞株.二代测序筛选出明显差异的mRNA及miRNA(P<0.05).Pathway显著性富集分析发现表达下调的基因与氨基酸合成,癌症转录调节紊乱,氨基酸代谢等相关的KEGG pathway有关,详见后述;沉默RYBP后,SPI1与hsa-miR-214-3p均表达降低(P<0.05).结论 RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因可能为:BBC3、BAI1、SESN2、CCNG2、JAK3、STAT4、SPI1、BCL6、CD11b和hsa-miR-214-3p.