中国HCV 2a的分子流行病学研究

目的 对我国HCV 2a亚型的分子流行病学进行研究.方法 收集全国18个省、直辖市HCV感染患者标本776份,逆转录巢式PCR扩增E1基因,通过比对得出HCV基因分型.从NCBI数据库中下载HCV 2a序列作参考序列,与此次的HCV 2a序列进行分析.在 Exponential模型下进行进化树构建以及BSP曲线绘制.结果 扩增E1基因664份,有8种亚型及HCV 6新亚型:1a、1b、1c、2a、3a、3b、6a、6n、6new的例数分别为10、392、3、127、28、48、44、6、6份.进化树分析显示HCV 2a于20世纪60年代早期分成了两簇,cluster Ⅰ全是来自中国的序列,主要是来自西北的序列,cluster Ⅱ包括了来自全球的序列,clusterⅤ、Ⅵ和Ⅶ显示日本与中国形成各自的传播网络,而cluster Ⅷ和Ⅸ均可以看出是由日本传到中国. BSP曲线显示1992—1996年增长速率明显较快.结论 全国范围内,HCV 1b为最主要亚型,2a次之,HCV 2a尤其在我国北方、东北、西北等省、直辖市分布比较高,还是应该引起足够的重视.进化分析显示HCV 2a一部分序列是由日本传到中国.