2014年深圳市流行的1型登革病毒分子溯源分析*

目的：对2014年深圳市登革热（DF）流行时分离的登革热1型病毒株（DENV-1）进行基因序列测定，了解其分子病毒学特征，探讨其可能来源。方法收集35份2014年深圳市DF患者急性期血清标本，用乳仓鼠肾细胞（BHK-21）分离DF病毒，并用逆转录-半套式聚合酶链反应（RT- PCR）反应对其进行型别鉴定。RT- PCR扩增全长基因，测序并进行同源性与进化树分析。结果35份血清样本中分离到DENV-121株。选取6株深圳DENV-1分离株测序，基因全长1485 bp，编码495个氨基酸。6株深圳市DENV-1分离株同源性为100.0％，其同源性与深圳市2010流行株接近，核苷酸和氨基酸同源性分别为99.5%和99.8%，与新加坡2009和日本2004流行株的核苷酸和氨基酸同源性最高达99.7%和100.0％。进化分析发现，深圳6株DENV-1属于基因型1型，与Shenzhen2010、Singpore2009、Japan2004的亲缘关系较近，在同一进化支上。结论2014年深圳市DENV-1属GⅠ亚型，最可能来源于东南亚一带，于2010年本地化而引起2014年DF流行。