实体组织外泌体相关基因参与肝细胞癌病变的分析

目的:探讨肿瘤微环境中外泌体相关组分的分布及其在肝细胞癌中的可能功能.方法:以肝细胞癌模型小鼠的瘤体组织和癌旁组织为实验材料,提取组织中总RNA并通过RNA-seq和生物信息学手段分析相关差异表达基因的功能和其编码蛋白的互作情况,并以RT-qPCR验证实验结果.结果:这些差异表达的相关基因共参与了1个信号通路、1个生物学过程、5个细胞组分和2个分子活性.从富集到的5个细胞组分可以看出,大量相关基因分布于细胞表面或细胞外区域;生物学过程为细胞粘连,分子活性为整联蛋白结合和蛋白酶结合,信号通路则为癌症中的蛋白聚糖.RT-qPCR与RNA-seq的数据比较表明,两种方法所得结果一致.结论:实体组织外泌体相关差异表达基因通过整合素和蛋白酶结合的细胞粘连途径参与肝细胞癌病变.