ASPM基因在乳腺癌中的表达及临床意义
Journal of Medical Research(2020)
Abstract
目的 研究有丝分裂相关基因ASPM(abnormal spindle microtubule assembly)在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨ASPM作用机制.方法 利用Oncomine数据库检测ASPM在乳腺癌组织中的表达情况,采用GSE3494数据集和Kaplan-Meier在线分析ASPM表达与乳腺癌患者的预后关系,并结合TCGA数据库分析ASPM表达与临床病理指标的相关性.利用GSE3494数据集进行基因富集分析(GSEA)预测ASPM相关通路.利用String数据库分析与ASPM相关的蛋白并通过TIMER数据库验证.利用RT-qPCR验证在13对乳腺癌组织与配对的癌旁组织中ASPM的表达情况.结果 与正常乳腺组织比较,ASPM在乳腺癌组织中高表达,且高表达组具有较短的总生存期(HR=1.71,P=0.000).GSE3494和TCGA数据库分析发现ASPM表达与ER、PR水平显著相关(P=0.000),TCGA数据库分析结果显示ASPM表达还跟年龄(P=0.002)以及TNM分期中的T分期(P=0.000)和N分期(P=0.030)显著相关.ASPM高表达样本主要富集在细胞周期、氧化磷酸化、DNA修复、错配修复、剪接体和蛋白酶体等基因集(P<0.01),结合String以及TIMER的结果,ASPM可能与BUB1、CCNA2、TTK、CDC20、CDK1相互结合作用,促进乳腺癌的发生、发展.RT-qPCR结果显示,ASPM在乳腺癌组织中表达上调.结论 ASPM基因在乳腺癌组织中高度表达,并与临床病理指标相关,可作为预测乳腺癌预后的标志物进一步研究.
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