糖尿病视网膜病变基因表达谱的改变及其发病机制
Modern Practical Medicine(2020)
摘要
目的 利用NCBI-GEO数据库糖尿病视网膜病变(DR)患者微阵列数据进行生物信息学分析,寻找潜在的有效药物治疗靶点.方法 从NCBI-GEO数据库提取数据集GSE53257,通过生物信息学软件分析,查找差异基因表达,并使用DAVID网站基因本体富集分析和信号通路分析,使用STRING实现蛋白质互作分析,寻找关键基因和潜在靶点.结果 共筛选出52个差异基因,差异基因主要富集于线粒体翻译、跨膜运输、细胞铁离子稳态、线粒体基质和内膜、核糖体的结构成分、羟酰基辅酶A脱氢酶活性和氧化还原酶活性等生物学过程.差异基因主要集中于代谢途径、氧化磷酸化、脂肪酸代谢、帕金森氏病和亨廷顿舞蹈病等信号通路;特别是多个关键基因参与线粒体和铁稳态过程.结论 通过生物信息学分析发现线粒体和铁稳态在DR发病过程中发挥重要的作用.
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