miR-194-5p靶基因预测及信号通路的生物信息学分析

目的 应用生物信息学分析miR-194-5p序列,预测其潜在的靶基因及信号通路.方法 通过PubMed、NCBI、UCSC等在线数据库查找miR-194-5p碱基序列,借助miRanda、TargetScan和miRDB预测miR-194-5p作用靶点,应用STRING平台和Cytoscape 3.7.0软件构建蛋白互作网络图,运用David在线数据库进行GeneOntology(GO)分析和KEGG信号转导通路富集分析.结果 已知的成熟miR-194-5p序列在不同物种间高度保守.蛋白质互作分析显示,miR-194-5p预测的靶基因所编码蛋白质间存在复杂的相互作用,尤其是靶基因HIST1H2BD、CASK、CHD4、CUL4B、DYRK1A等编码的蛋白质起关键作用.GO分析发现其靶基因参与Golgi组织、伤口愈合、细胞对DNA损伤刺激的反应等生物学过程,KEGG分析显示富集在泛素介导的蛋白水解信号通路.结论 分析结果初步提示miR-194-5p通过调控靶基因广泛参与多种重要的生物学过程,为后期开展miR-194-5p实验研究提供新的思路与线索.