桃MPK3基因的克隆、表达及生物信息学分析

为探究MPK3响应GA信号调控休眠解除的分子机理,以中油四号油桃为试验材料,通过实时荧光定量PCR发现GA诱导下MAPKs家族基因在桃芽中有不同程度的表达,其中PpMPK3响应GA正调控表现最强烈.利用MEGA6.0、MEME、GSDS、DNAMAN 6.0等软件对桃PpMPK3基因进行生物信息学分析,结果表明,PpMPK3的cDNA全长1 113 bp,编码370个氨基酸,蛋白分子量约为42.6 kD,理论等电点为5.62,属于亲水性不稳定蛋白.预测PpMPK3蛋白发生磷酸化修饰的位点有45个,不存在糖基化位点.PpMPK3蛋白的二级结构中α-螺旋占41.35％,延伸链占10.54％,无规则卷曲为48.11％.进化树分析表明,PpMPK3氨基酸序列与甜樱桃亲缘关系最近,同源性为99.73％.通过亚细胞定位发现,PpMPK3定位于细胞核.RT-PCR结果表明,PpMPK3的表达模式与休眠解除过程相一致,推测PpMPK3能够响应GA信号,促进休眠解除.本研究结果为桃设施栽培的休眠调控提供了一定的理论依据.