基于桑葚转录组测序的SSR位点分析
Molecular Plant Breeding（2020）
摘要
采用转录组测序技术对三个时期的桑葚进行转录组测序,建立桑葚的EST数据库.基于生物信息学方法分析桑葚转录组数据库的简单重复序列位点.从51 895条Unigenes中共检索出23 641条Unigenes含有44 867个简单重复序列位点,共计252种基序类型.在所有基序类型中,以A/T与AT/AT型出现次数最多.单核苷酸基序类型与二核苷酸基序类型出现频率最高,共计75.69％.基序长度以10～20 bp为主,重复次数集中5～18次.设计27 149对引物,随机选择20对引物,通过PCR验证,在4个桑树品种中展现出良好的重现性与通用性.桑葚转录组SSR位点类型丰富,具备开发出适宜于果桑选育的分子标记的潜力.
更多AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树，研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要