四引物分子标记鉴定水稻光合效率基因TAC1的不同基因型

水稻(Oryza sativa)的株型含株高、分蘖、穗型和叶型等性状,其表现与光合效率直接相关.一般地,籼稻(Oryza sativa ssp.xian)株型松散,而粳稻(Oryza sativa ssp.geng)更为紧凑.松散型的籼稻自身遮蔽少,通风好,植株光合效率高;紧凑株型的粳稻适应密植,通过提高单位面积植株数量提高总体光合效率.控制籼粳稻分蘖角度差异的主效基因是TAC1基因.相比TAC1xian,发生在tac1geng雕的3’非翻译区(3'UTR)的A→G突变导致mRNA稳定性下降,从而影响了粳稻的株型.2个等位基因分别属于单株高光效基因型和整体高光效基因型,处于杂合状态下还可互补,因此建立可精确选择TA C1等位基因的分子标记在育种实践中意义重大.本研究利用扩增受阻突变系统(amplification refractory mutation syste,ARMS)的原理,开发出包含4条引物的共显性分子标记,鉴定TAC1的功能单核苷酸多态性(functional nucleotide polymorphism,FNP).该分子标记命名为tac1fnp,同TAG1完全连锁,一次PCR反应即可精确区分2种等位基因及杂合基因,有助于水稻的高光效分子标记辅助选择育种.