基于分子标记的栽培番茄遗传多样性与遗传结构分析

为分析国内外收集的栽培番茄间的遗传多样性,了解其亲缘关系,本研究选择31对InDel标记与10对SSR标记对96份国内外栽培番茄种质资源进行遗传多样性和遗传结构分析.结果 表明,共检测到87个等位基因,平均每个位点等位基因数为2.122个;主等位基因频率变化范围为0.589～0.995,平均值为0.874;基因多样性指数变化范围为0.010～0.496,平均值为0.200;多态性信息含量为0.010～0.404,平均为0.172.96份栽培番茄种质资源间的遗传距离为0.012～0.728,平均遗传距离为0.216.通过聚类分析,将96份栽培番茄材料在遗传距离为0.306时划分为三个类群.通过遗传结构分析,在K=3时,将96份栽培番茄划分为三个群体,两种类群划分有相似的结果.聚类分析和遗传结构分析结果表明,来自不同国家的栽培番茄混杂分布,具有相似的遗传背景,96份栽培番茄种质资源的类群划分与其地理来源之间无直接关系.该研究可为栽培番茄种质资源的有效利用、亲本选择和新品种的遗传改良提供依据.