陆地棉GhC4H基因家族分析
Molecular Plant Breeding（2020）
Abstract
肉桂酸-4-羟化酶(C4H)是苯丙烷代谢途径途径的一个重要的调控酶,在植物木质素的合成中起着重要作用.本研究通过对陆地棉基因组数据进行筛选,共鉴定得到4个GhC4H基因成员,分析发现所有成员均属于碱性蛋白质,氨基酸数目均为505,具有相似的理化性质、等电点和分子量等性状.进化树分析表明植物C4H蛋白主要分为两类.陆地棉4个GhC4H基因成员均分布于染色体的正链下方,亚细胞定位均在细胞质膜上.4个GhC4H启动子序列中均有MBS顺式作用元件,只有一个成员没有AC顺式作用元件.4个GhC4H基因之间的Ka/Ks值均小于0.5,表明在进化过程中比较保守.通过转录组数据分析发现4个GhC4H基因在叶中相比其他组织中的表达量高,随着棉花纤维的发育4个GhC4H基因变化趋势均是从高到低.本研究为揭示陆地棉GhC4H基因家族的生物学功能提供了理论参考.
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