辣椒HD-Zip转录因子家族鉴定与生物信息学分析
Molecular Plant Breeding（2020）
摘要
从辣椒基因组数据库中鉴定HD-Zip转录因子,并对其进行生物信息学分析.对鉴定到的转录因子的基本理化性质、染色体定位、系统进化、保守基序和基因结构进行分析.共鉴定到45个辣椒HD-Zip转录因子;该家族成员均含有高度保守的HD-Zip结构域;45个HD-Zip基因以不均匀的方式分布在12条染色体上.根据拟南芥HD-Zip家族分类关系,在结合辣椒HD-Zip基因结构的特点分为Group Ⅰ、GroupⅡ、GroupⅢ和GroupⅣ.辣椒HD-Zip转录因子在同一亚族中含有相同的保守基序和基因结构.本研究初步明确了辣椒HD-Zip转录因子家族成员进化关系和结构特点,为进一步研究辣椒HD-Zip转录因子家族的系统发育以及生物学功能提供了依据,为辣椒的分子育种提供科学依据.
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