山核桃(Carya cathayensis)种子生长发育过程转录组的初步分析

山核桃(Carya cathayensis)是浙江省重要的经济树种,其种子脂类含量极高,达69.80％～74.01％.本研究采用Illumina HiSeqTM 2000高通量测序技术对高油种子生长发育过程(6个时间点)采集的种胚及胚乳进行转录组分析,经组装拼接共获得Unigene 110 959条,占总转录本数的53.93％,并有39 560个Unigene至少在7个数据库中的一个数据库中获得注释.这些注释的基因GO分类共涉及47个生物学功能,KOG分类成26组,KEGG代谢通路分成5个分支.基因差异表达分析表明,胚乳在种子生长发育被吸收的过程中基因表达量不低,上下调基因数均是先增加后减少,而同一时间点上下调胚与胚乳差异表达基因(DEG)数均逐渐增加.DEG聚类分界点在7～8月之间.初步发现山核桃种子生长发育过程涉及脂类合成的途径21个,相关基因571个.这些结果为山核桃日后成油机理的研究打下了基础.