12个辣椒microRNA的靶标预测及表达分析

Molecular Plant Breeding(2018)

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摘要
为了探索12个辣椒microRNA的时空表达及胁迫响应.根据辣椒中己鉴定和注释的microRNA信息,进行靶标预测和时空表达分析.靶标除转录因子外,还有ABC transporter、WD40和锌指结构等.辣椒中miRNA表达具有组织特异性,并且miRNA在果实发育中也起作用.同时,对辣椒进行脱落酸、茉莉酸甲酯、高温、低温、盐和辣椒疫病病原菌处理.采用实时荧光定量PCR检测12个miRNA在不同处理下的表达情况.结果发现microRNA对胁迫有响应,对胁迫呈现出显著性表达差异,miR4414b受疫病胁迫上调表达,miR167在脱落酸胁迫下下调表达,miR396d经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病诱导后,显著上调表达.miR156在高温和低温胁迫下下调,靶标转录因子SBP可能上调,适应胁迫反应.但miR156a经NaC1诱导后显著上调表达,可能导致靶标下调表达.miR171c经脱落酸、茉莉酸甲酯和疫病处理显著下调,靶标GRAS基因可能上调抵抗胁迫,本研究对辣椒中miRNA的进一步研究提供帮助.
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