玉米SSR标记DNA指纹数据库中N+1峰的消除
Molecular Plant Breeding（2017）
摘要
为解决玉米SSR标记DNA指纹数据库构建时,N+1峰带来的指纹数据标准化采集问题,本研究对40个玉米品种鉴定核心引物进行评估,其中13对引物的扩增产物产生N+1峰.对于这些引物,通过增加PCR程序最后一步的延伸时间和下游引物5’端加一个G(鸟嘌呤)两种方法进行N+1峰的消除.结果表明:与标准中提供的程序和引物序列相比,将PCR程序最后一步的延伸时间增加至90 min,消除了9对引物扩增产物的N+1峰,下游引物5’端加一个G能消除12对引物扩增产物的N+1峰.最终提出两种消除N+1峰的方案,均能有效改善玉米标准DNA指纹数据库的图谱质量.
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