香蕉叶片响应盐胁迫转录组分析

Molecular Plant Breeding(2017)

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摘要
通过利用新一代高通量测序手段——转录组测序(RNA-Seq)技术研究巴西蕉(Musa paradisiaca)叶片在60 mmol/L NaC1人工模拟盐胁迫0、12h、24 h不同时间点的转录组分析.结果表明:盐胁迫12h上调和下调的DEGs (differential-expressed genes)分别为2 938个和2 727个;24h分别有834个和893个.GO富集分析,差异基因主要在细胞过程、代谢过程、刺激响应、结合以及催化活性等.KEGG分析,差异基因主要涉及代谢途径、光合作用、黄酮类生物合成、苯丙素生物合成等.通过GO和KEGG显著性富集分析发现,NaC1胁迫12h后差异表达的基因数明显多于24 h胁迫后的差异基因表达数.qRT-PCR验证了DEGs的表达趋势与RNA-Sep测序分析结果的一致,证明了RNA-Sep结果的准确性.本研究通过香蕉叶片转录组分析,为研究香蕉耐盐分子机制提供参考.
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