水芹OjHSP90基因克隆及生物信息学分析
Molecular Plant Breeding（2016）
摘要
本研究从水芹中克隆得到一个HSP基因OjHSP90,生物信息学分析表明:水芹OjHSP90基因全长2 100bp,编码699个氨基酸;OjHSP90蛋白的理论分子量为80.3 kD,等电点为5.01,是一种亲水性的稳定蛋白;OjHSP90蛋白的二级结构中,α-螺旋占52.93％,延伸链占16.74％,β-折叠占5.87％,无规则卷曲占24.46％;该蛋白的N端含有1个HSP90超家族蛋白保守的结构域YSNKEIFLRE,能够与ATP结合;进化树分析表明,OjHSP90蛋白与拟南芥AtHSP90蛋白和烟草NtHSP90的相似度最高,分别为91.99％和92.13％.本研究旨在为进一步研究HSP90基因的功能以及研究水芹耐高温途径提供理论参考.
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