新疆7个小麦种5S rDNA及其NTS序列分析

本研究参照GeneBank中禾本科植物大麦5S rDNA序列，利用PCR技术扩增获得新疆7个小麦种5S rDNA部分序列，进一步与禾本科植物大麦5S rRNA序列比对，得到了5S rDNA结构和NTS边界范围。序列分析发现，不同类型小麦5S rDNA序列保守程度不同，其中大片段保守性较高，小片段相对较低，7个小麦种5S rDNA序列均存在不同程度的插入和缺失序列，同种不同类型和不同种5S rDNA非转录间隔区(NTS)长度和存在位置均呈现不同程度差异。利用MEGA4.0软件，采用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建分子进化树并计算种间遗传距离。以7个小麦种进化关系的分析结果为依据，利用5S rDNA两种类型片段建立了两种不同的亲缘关系分类依据，旨在为新疆7个小麦种亲缘关系分析提供一定理论依据，以期为后期种间同源关系分析，建立序列集合，推导系统进化与发育关系，重建发育史和遗传育种奠定一定理论依据。