河南主推旱稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

Molecular Plant Breeding（2014）

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Abstract

为构建河南早稻种植品种的DNA指纹图谱,了解河南早稻的遗传多样性,本研究利用均匀分布于水稻12条染色体的38对SSR引物,以河南主要推广种植的10个早稻品种为材料,进行遗传多样性分析并构建SSR指纹图谱.结果表明,35对引物具有多态性片段,共检测到108个等位基因,平均每位点3.1个等位基因;引物平均多态性频率为0.485.10个品种间的遗传相似系数为0.435～0.907,平均0.678.利用RM552、RM171、RM5、RM308、RM338、RM17和RM587 7对多态性较高的SSR引物构建的核心指纹图谱能区分出10个早稻品种.采用非加权类平均法进行聚类分析,在遗传相似系数0.480处可将10个品种分为籼、粳两大类.

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