黄瓜花叶病毒(CMV)2个山西分离物CP序列测定及亚组分类分析

在生物学检测的基础上,利用酶联免疫检测、非序列依赖性PCR(sequence-independent amp-lification,SIA)对感病番茄进行分子鉴定,表现卷叶和花叶症状的番茄均被黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)侵染,分离物分别命名为SXFQ(GenBank登录号为JX993914)和FQ(GenBank登录号为JX993912).为明确其分类地位,对二者外壳蛋白(coat pro-tein,CP)进行克隆和测序分析.应用DNAMAN软件对本课题组前期检测的7个CMV山西分离物、SXFQ、FQ以及其他3个CMV典型分离物CP序列进行比较分析,发现核苷酸和氨基酸序列最大相似性分别为77.1％ ～ 100％和81.6％～100％.氨基酸序列系统进化分析表明,9个CMV山西分离物属于CMV亚组ⅠB的2个分支,其中在指示植物上表现较强症状的SXFQ与其他5个分离物为一分支,在指示植物上表现较弱症状的FQ与其他2个分离物为另一分支.对9个山西分离物CP进行亚组分类分析,结果表明其理化性质、稳定性、疏水性与预测结果相近,2个分支的分离物分别出现相近的氨基酸变异和蛋白结构,存在一定规律性.