小麦幼苗内生菌多样性的宏基因组分析

小麦是世界各地广泛种植的重要禾本科作物,在生长过程中与内生菌形成和谐共生的微生态体系,内生菌次生代谢产物具有抗病、防虫与促生等重要作用.宏基因组技术是研究环境微生物及内生菌多样性的重要手段.本研究首先富集纯化幼苗期小麦内生菌的宏基因组DNA,PCR扩增内生细菌的16S rDNA及内生真菌rDNA-ITS序列,构建了大肠杆菌克隆文库,选取阳性克隆测序.根据16S rDNA信息及系统进化树对内生细菌群初步分析,划分为9个分类操作单元(operational taxonomic unites,OTUs),主要包括γ-变形菌纲肠杆菌科(95.59％)、梭菌纲(1.47％)及不可培养细菌(2.94％),其中肠杆菌科菌群为优势菌.内生真菌rDNA-ITS克隆序列根据序列相似性和系统发育分析划归为13个OTUs,主要为不可培养真菌(37.50％)与子囊菌(62.50％),后者分属于半子囊菌纲(30.00％)、座囊菌纲(5.00％)与粪壳菌纲(27.50％)3个菌纲,其中不可培养真菌为优势菌.上述研究结果表明小麦幼苗内生菌遗传多样性分布较广,本研究为进一步挖掘利用小麦内生菌资源提供了基础信息.