水稻黑条矮缩病毒和水稻条纹叶枯病毒侵染下水稻qRT-PCR内参基因的筛选

病毒侵染通常会干扰寄主细胞的生理代谢过程,分析病毒侵染后寄主基因的表达差异,将为病毒与寄主之间的互作研究提供重要的分子基础.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)是目前基因表达分析中应用最广泛的方法之一,选择合适的内参基因对实验进行校正和标准化至关重要.但是,一些常用作内参的看家基因会受到病毒侵染的影响.本研究中,以感染水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarf virus,RBSDV)和水稻条纹叶枯病毒(Rice stripe virus,RSV)的水稻总RNA为材料,利用qRT-PCR技术和3个统计学软件探讨了10个常用内参基因在病毒侵染下的稳定性.结果显示,感染RBSDV和RSV水稻中表达最稳定的都是UBC和β-TUB.因此,可选用UBC和β-TUB组合作为分析RBSDV和RSV侵染过程的水稻内参基因.