3个黑龙江烟区烟草花叶病毒分离物的全基因组序列测定与分析

为明确黑龙江烟区烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到HEB1、HEB2和MDJ三个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析.结果表明,3个分离物全长均为6395核苷酸(GenBank登录号分别为MH595919、MH595920和MH595921).HEB1和MDJ与辽宁分离物Beipiao (HE818412)一致率最高,分别为98.9％和99.6％;HEB2与云南分离物Chuxiong1 (HE818417)一致率最高,为97.1％.HEB1是MDJ和HEB2的重组体.在根据全基因组序列构建的系统进化树中,TMV分为3个组,其中HEB1和MDJ均属Ⅰ (U1)组,HEB2属Ⅱ(Rakkyo)组.TMV的4个基因均处于负选择,其中衣壳蛋白基因的选择压力最大.