亚麻荠油脂相关转录因子CsLEC2基因家族的鉴定及表达分析

Crops(2020)

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摘要
对亚麻荠CsLEC2家族进行全基因组鉴定、半定量RT-PCR、qRT-PCR,检测CsLEC2基因的时空表达特性并通过转录组数据预测CsLEC2下游靶基因,以解析CsLEC2调控亚麻荠种子油脂合成和积累等生物学功能.结果 表明,在亚麻荠基因组中共鉴定到3个亚麻荠CsLEC2基因(CsLEC2.1、CsLEC2.2和CsLEC2.3).蛋白理化性质和高级结构分析显示,亚麻荠CsLEC2蛋白具有与拟南芥AtLEC2相似的理化性质,且其二级结构的主体也相似.系统进化分析表明,亚麻荠CsLEC2蛋白与模式植物拟南芥AtLEC2蛋白及拟南芥琴亚种A1LEC2蛋白亲缘关系最近.qRT-PCR结果显示亚麻荠CsLEC2在未成熟的种子中高表达.转录组数据分析显示下游基因Cs WRI1和CsOLE3高表达,推测CsLEC2可能直接上调Cs WRI1和CsOLE3的转录表达,参与油脂代谢调控.
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