南亚实蝇转录组及嗅觉相关基因的初步分析
Chinese Journal of Tropical Crops(2019)
摘要
南亚实蝇Bactrocera tau(Walker),是葫芦科、茄科蔬菜和多种热带、亚热带果树上的主要害虫,抗逆性强,繁殖速度快,防治难度大.为挖掘可用于生物防治的分子靶标和探讨副信息素类引诱剂对其作用的分子基础,本研究采用Illumina HiSeq2500 PE125 bp测序技术对其混合样进行转录组测序和生物信息学分析.经序列拼接获得36109条Unigenes,进一步与七大公共数据库进行同源比对,注释了21127条Unigenes,其中在Nr数据库中注释成功的Unigenes数目最多,20948条.Nr数据库注释的南亚实蝇B.tau Unigenes与地中海实蝇Ceratitis capitata同源性最高,达59.80%;与模式昆虫黑腹果蝇Drosophila melanogaster的同源性次之,达14.86%.将Unigenes与GO数据库比对发现,14029条Unigenes根据功能分为了3个大类57个亚类;而与KOG数据库比对结果为,13479个Unigenes基因其功能属于25个类别;进一步KEGG数据库代谢分析表明,6442条Unigenes参与了5大类共152个代谢通路.基因注释进一步筛选鉴定获得了嗅觉相关基因528个,对其中气味结合蛋白基因氨基酸序列的分析表明,其大多为具有6个保守的半胱氨酸位点的典型气味结合蛋白,且与黑腹果蝇D.melanogaster、地中海实蝇C.Capicata、瓜实蝇B.cucuribitae、橘小实蝇B.dorsalis的气味结合蛋白基因具有很高的同源性.这为南亚实蝇对副信息素类引诱剂反应的相关功能基因的挖掘及从嗅觉上寻求科学的防治措施提供了基础数据.
更多AI 理解论文
溯源树
样例
![](https://originalfileserver.aminer.cn/sys/aminer/pubs/mrt_preview.jpeg)
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要